More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0454 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  67.18 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  64.5 
 
 		 262 aa  346  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  63.5 
 
 		 267 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  63.5 
 
 		 267 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  62.36 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  63.12 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  63.12 
 
 		 267 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  63.74 
 
 		 267 aa  332  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  60.08 
 
 		 264 aa  332  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  63.02 
 
 		 267 aa  332  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  62.64 
 
 		 267 aa  331  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  62.64 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  63.12 
 
 		 269 aa  328  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  62.6 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  59.62 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  52.53 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  51.91 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  52.53 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  52.33 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  51.15 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  52.14 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  51.15 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  51.75 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  50.97 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  51.36 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  51.36 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  51.36 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  50.77 
 
 		 264 aa  268  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  51.36 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  51.36 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  50.97 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  49.8 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  49.81 
 
 		 264 aa  265  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  49.8 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  49.8 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  49.8 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  49.8 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  49.41 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  51.34 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  46.54 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  51.22 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  46.74 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  50.81 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  47.79 
 
 		 278 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  47.79 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  44.96 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  49.59 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  47.37 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  46.92 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  49.79 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  45.98 
 
 		 270 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  46.54 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  45.83 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  50.81 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  44.44 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  45.83 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  44.57 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  45.56 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  42.86 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  39.54 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.61 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3635  deoxyribonuclease TatD  47.24 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.29 
 
 		 464 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  38.61 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.4 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.14 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  36.05 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.38 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.75 
 
 		 606 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  34.72 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.08 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.67 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.08 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  34.43 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.84 
 
 		 462 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.38 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.27 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  33.08 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  36.64 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.69 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.69 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.69 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.69 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.69 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.47 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  34.32 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.69 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  32.69 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.69 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.61 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>