More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0891 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  47.18 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 461 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.04 
 
 		 464 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  41.34 
 
 		 458 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  36.76 
 
 		 462 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  40 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.64 
 
 		 606 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  39.27 
 
 		 276 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 		 458 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.57 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.25 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  34.8 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.6 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  41.73 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  39.45 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  41.73 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  34.9 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.8 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0528  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.95 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.25 
 
 		 462 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  36.4 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  35.86 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 457 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  36.9 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  36.22 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  37.19 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  35.43 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  34.13 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  34.8 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  39.04 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  38.65 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.7 
 
 		 459 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.1 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  36.61 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  34.4 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.8 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.8 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.8 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.8 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.8 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.25 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.8 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  40.24 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.13 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  34 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.8 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.96 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.8 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  34.8 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0151  TatD-related deoxyribonuclease  39.22 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  34 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  37.88 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  39.13 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  38.74 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  40.55 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.25 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  34.14 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  38.65 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  38.74 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  35.89 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.28 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.28 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  37.14 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  38.13 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  34.92 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 		 285 aa  151  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  35.77 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  42.23 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  35.77 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  35.77 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  34.35 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  34.39 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.85 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  35.77 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.92 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  37.23 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  35.77 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  34.26 
 
 		 454 aa  149  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  35.77 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>