More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0398 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  67.21 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  61.51 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  55.67 
 
 		 276 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  55.47 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  54.01 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  57.04 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  52.78 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  53.85 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  49.67 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  51.49 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  53.24 
 
 		 287 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  54.23 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  46.78 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  48.75 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  49.16 
 
 		 309 aa  251  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  48.46 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  48.05 
 
 		 305 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  51.99 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  47.86 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  51.26 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  48.97 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  51.57 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  45.97 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  45.97 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  45.26 
 
 		 374 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  45.78 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  45.36 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  45.52 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  46.43 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  43.77 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  49.83 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  43.88 
 
 		 285 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  42.01 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  43.97 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  47.29 
 
 		 256 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  44.13 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  39.85 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.46 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  40.36 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.27 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.41 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.85 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.27 
 
 		 606 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.71 
 
 		 457 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.91 
 
 		 462 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.64 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.91 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.91 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  35.51 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.91 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.91 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.91 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.91 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.91 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.55 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.31 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  36.79 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.1 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.1 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  34.91 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.74 
 
 		 256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  38.41 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  32.63 
 
 		 266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35.02 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.02 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.14 
 
 		 462 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.87 
 
 		 458 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.85 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  32.73 
 
 		 255 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  33.82 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.92 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  36.5 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.51 
 
 		 458 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  39.27 
 
 		 270 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  37.18 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  38.93 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.82 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.7 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  38.18 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  38.13 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  39.15 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  36.59 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.26 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  40.93 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  36.17 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  40.96 
 
 		 250 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  37.32 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  34.66 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.09 
 
 		 265 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  36.96 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  36.96 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  36.96 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  36.96 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  37.41 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.1 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  39.07 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>