More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0781 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  100 
 
 		 322 aa  634    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  84.78 
 
 		 309 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  57.37 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  54.27 
 
 		 272 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  59.18 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  54.79 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  51.15 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  47.56 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  49.84 
 
 		 274 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  47.87 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  50.49 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  45.91 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  57.64 
 
 		 274 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  45.23 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  55.61 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  48.11 
 
 		 274 aa  248  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  47.53 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  45.95 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  43.75 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  42.51 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  49.79 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  43.68 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  45.83 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  49.18 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  42.81 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  51.26 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  52.44 
 
 		 274 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  48.02 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  42.67 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  43.75 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  42.62 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  42.62 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  42.62 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  47.54 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  46.72 
 
 		 265 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  46.72 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 		 256 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.51 
 
 		 606 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  41.6 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  32.84 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.05 
 
 		 462 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  34.11 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  35.68 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.17 
 
 		 256 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  36.97 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.89 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.4 
 
 		 457 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  37.71 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.39 
 
 		 464 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  39.66 
 
 		 264 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  32.31 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  36.59 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  39.09 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  39.34 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  36.1 
 
 		 255 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 		 458 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 		 458 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  37.76 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  40.18 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.33 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  34.98 
 
 		 255 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  34.98 
 
 		 255 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  35.68 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  34.85 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.91 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.68 
 
 		 255 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.68 
 
 		 255 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.68 
 
 		 255 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.68 
 
 		 255 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.68 
 
 		 255 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  38.05 
 
 		 261 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.98 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.91 
 
 		 256 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  35.68 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  39.34 
 
 		 258 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.15 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  37.87 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  35.95 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  42.74 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.27 
 
 		 255 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  39.64 
 
 		 257 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  42.74 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  36.78 
 
 		 255 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.58 
 
 		 256 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 250 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  36.6 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.36 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  34.89 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  38.14 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  37.76 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  37.61 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.6 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  37.5 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  38.49 
 
 		 259 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  38.16 
 
 		 260 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>