More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1552 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  100 
 
 		 319 aa  655    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  55.69 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  47.76 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  49.68 
 
 		 303 aa  279  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  47 
 
 		 305 aa  270  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  47.44 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  45.55 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  43.79 
 
 		 374 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  42.48 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  46.52 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  41.95 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  41 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  37.86 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  37.17 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  41.91 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  43.21 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  40.07 
 
 		 275 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  39.04 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  40.23 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  39.33 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  37.16 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  35.67 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  40.17 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  40.17 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  40.17 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  38.65 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  35.71 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  36.4 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  37.12 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  40.35 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  34 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  48.24 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  36.84 
 
 		 281 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  34.34 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.32 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34.85 
 
 		 464 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  34.21 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.85 
 
 		 458 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.83 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.7 
 
 		 606 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.09 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.9 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  31.68 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  33.58 
 
 		 461 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  33.71 
 
 		 462 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  33.08 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  33.08 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 		 457 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  39.06 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  30.53 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  31.82 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  31.06 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  38.92 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  39.29 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  29.17 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  30.65 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  30.8 
 
 		 258 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  30.3 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.94 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  31.42 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  28.75 
 
 		 256 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  28.63 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  40.34 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  34 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  28.47 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  29.17 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  28.68 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  26.62 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  29.17 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  30.3 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  30.11 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  29.58 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  36.9 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.23 
 
 		 264 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  32.55 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  33.51 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  37.87 
 
 		 261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  29.44 
 
 		 251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  29.28 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  33 
 
 		 257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  36.46 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  34.63 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  29.55 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  30.8 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0212  hydrolase, TatD family  38.32 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.02285e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  29.17 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  34.39 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.79 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.79 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  30.08 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  35.75 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>