More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  65.8 
 
 		 310 aa  367  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  61.64 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  60.07 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  62.79 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  57.04 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  56.31 
 
 		 374 aa  286  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  47.76 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  54.24 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  52.44 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  49.12 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  44.56 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  51.93 
 
 		 275 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  46.28 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  51.2 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  50.53 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  44.74 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  49.65 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  48.94 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  46.18 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  47.22 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  47.7 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  46.51 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  45.45 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  48.06 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  43.42 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  44.68 
 
 		 256 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  43.25 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  42.31 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  39.3 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  40.56 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.01 
 
 		 464 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  51.1 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  39.5 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  40.54 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  40.54 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  39.93 
 
 		 265 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.69 
 
 		 606 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  36.75 
 
 		 462 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  38.25 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.7 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.5 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.56 
 
 		 256 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  38.19 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.04 
 
 		 457 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  32.86 
 
 		 257 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.87 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.51 
 
 		 458 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  30.39 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.14 
 
 		 458 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.5 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.81 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.22 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  30.63 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  30.22 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.11 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  33.69 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  29.33 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  34.55 
 
 		 282 aa  149  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  31.56 
 
 		 253 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  35.46 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  30.74 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.21 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  35.87 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  30.74 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  30.39 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  30.74 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  30.39 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  30.39 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  30.39 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  30.39 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  30.39 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  32.04 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  35.07 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  30.9 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  29.86 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  34.15 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  35.44 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  39.46 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  34.62 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.8 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  31.15 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  33.1 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  33.09 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  32.96 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  38.33 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  32.17 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  32.45 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.52 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  30.6 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  31.23 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  28.62 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  31.23 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  30.18 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 270 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  29.37 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  39.88 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.81 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  29.66 
 
 		 255 aa  135  9e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>