More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1956 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 303 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  60.07 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  57.98 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  54.1 
 
 		 305 aa  332  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  52.49 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  50 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  50.68 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  46.6 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  47.16 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  51.15 
 
 		 374 aa  251  8.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  45.77 
 
 		 295 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  48.24 
 
 		 301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  45.64 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  44.92 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  50.65 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  44.72 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  45.42 
 
 		 274 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  48.97 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  45.04 
 
 		 275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  43.68 
 
 		 322 aa  215  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  40.66 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  41.08 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  40.21 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  40.46 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  43.03 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  39.52 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  38.82 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  38.16 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  39.51 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  51.09 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  35.79 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.97 
 
 		 464 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  35.41 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  34.67 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  34.67 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  35.07 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  30.5 
 
 		 258 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  44 
 
 		 265 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  36.14 
 
 		 278 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.9 
 
 		 462 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  33.22 
 
 		 458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.69 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.45 
 
 		 462 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  33.22 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  35.44 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  43.79 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.46 
 
 		 606 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.35 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.71 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  34.04 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 		 269 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.22 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  31 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  32.66 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  30.31 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  32.35 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  31.73 
 
 		 255 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  33.06 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  31.45 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  35.79 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  28.92 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  33.1 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  30.99 
 
 		 260 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.44 
 
 		 457 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  32.16 
 
 		 461 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  32.04 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  31.54 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  29.58 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  28.17 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  40.76 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  29.58 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.98 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  34.44 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  30.63 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.87 
 
 		 255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  33.1 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  30.88 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  30.88 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  42.77 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  28.87 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1177  hydrolase TatD family  32.75 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00325246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  30.63 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  40.11 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  30.18 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  32.97 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  32.28 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  31.93 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  30.18 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.52 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.52 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.52 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.52 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.87 
 
 		 255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  33.88 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  34.34 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  30.51 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>