More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11027 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  77.52 
 
 
285 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  78.38 
 
 
265 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  78.38 
 
 
283 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  78.38 
 
 
283 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  75.77 
 
 
283 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  62.55 
 
 
293 aa  326  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  63.18 
 
 
285 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  63.71 
 
 
281 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  62.69 
 
 
280 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  59.62 
 
 
256 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  47.27 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  44.23 
 
 
276 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  45.52 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  47.37 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  44.33 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  43.64 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  47.15 
 
 
301 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  45.28 
 
 
295 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  44.21 
 
 
303 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  40.38 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  48.29 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  43.4 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.46 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  39.62 
 
 
255 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.62 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.62 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  47.74 
 
 
275 aa  194  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
255 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  38.46 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 
274 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.23 
 
 
255 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 
256 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  44.33 
 
 
309 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  44.98 
 
 
274 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  46.72 
 
 
322 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  43.4 
 
 
317 aa  188  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  44.14 
 
 
374 aa  188  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  43.68 
 
 
274 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
263 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.22 
 
 
256 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.78 
 
 
464 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  34.57 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.6 
 
 
462 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  47.08 
 
 
274 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  37.36 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.88 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
258 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 
256 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  34.08 
 
 
266 aa  177  2e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  39.79 
 
 
305 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 
458 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  38.19 
 
 
303 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
264 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.58 
 
 
606 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  36.6 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.12 
 
 
257 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  40 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 
259 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  37.07 
 
 
255 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.55 
 
 
458 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.98 
 
 
256 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  36.29 
 
 
255 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.02 
 
 
255 aa  168  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.02 
 
 
255 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  33.2 
 
 
260 aa  168  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  39.77 
 
 
270 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  39.85 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  40.38 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  34.87 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  37.93 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.31 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  38.01 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.62 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  40.53 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  32.82 
 
 
260 aa  163  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.64 
 
 
267 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  38.2 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.49 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  37.36 
 
 
264 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  36.84 
 
 
319 aa  162  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.21 
 
 
255 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  38.4 
 
 
263 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  37.01 
 
 
258 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.08 
 
 
462 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 
261 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.5 
 
 
259 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  43.24 
 
 
257 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  43.24 
 
 
257 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  43.83 
 
 
250 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.16895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>