More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3234 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  63.18 
 
 		 285 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  61.45 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  61.45 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  61.87 
 
 		 285 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  58.3 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  62.07 
 
 		 265 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  63.71 
 
 		 264 aa  299  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  61.39 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  56.83 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  48.89 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  48.12 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  49.06 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  46.48 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  48.74 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  45.64 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  45 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  50.43 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  46.64 
 
 		 309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  45.3 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  46.39 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  48.12 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  43.73 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  45.45 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  47.19 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  48.09 
 
 		 275 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  42.23 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  41.47 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  43.02 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  45.53 
 
 		 328 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  43.07 
 
 		 374 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  40.54 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  56.11 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.46 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  42.26 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  41.89 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.3 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.7 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.7 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  39.92 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.92 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  38.49 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.92 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  39.54 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  39.92 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  39.16 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.78 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  39.74 
 
 		 310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.16 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  39.62 
 
 		 606 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  36.47 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.85 
 
 		 462 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  40.38 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.08 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  36.88 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.38 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  35.25 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  40.82 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.85 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.85 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.08 
 
 		 458 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  37.69 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  39.62 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  40.45 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  39.54 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.17 
 
 		 457 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.86 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  36.4 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  41.22 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  40.82 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  40.3 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  37.97 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  35.63 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  38.7 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  38.08 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  37.4 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  38.26 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  37.4 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  39.7 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  37.79 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  39.02 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  38.66 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.02 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  40.45 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 		 255 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>