More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1511 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  64.36 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  64.36 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  65.64 
 
 		 265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  63.18 
 
 		 285 aa  323  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  61.24 
 
 		 285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  62.55 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  60.58 
 
 		 283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  58.3 
 
 		 281 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  60.31 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  57.62 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  47.19 
 
 		 276 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  47.2 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  44.37 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  48.86 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  44.48 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  45.58 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  43.12 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  43.55 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  47.31 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  44.41 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  40.7 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  42.75 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 255 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  44.44 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  40.7 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  42.75 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.31 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  46.04 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.7 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  40.31 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  46.96 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  39.92 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.92 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.31 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  39.53 
 
 		 255 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  44.27 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  50.23 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  42.96 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.79 
 
 		 464 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.23 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.08 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  40.61 
 
 		 257 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.55 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  39.38 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  40.77 
 
 		 256 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  39.62 
 
 		 263 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  41.54 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 256 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  37.84 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  40.61 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  39.23 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  39 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  40 
 
 		 264 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  37.84 
 
 		 258 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  38.08 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  50.28 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  38.87 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.92 
 
 		 255 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.15 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0151  TatD-related deoxyribonuclease  39.41 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  37.84 
 
 		 263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  40.45 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  40.47 
 
 		 250 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.25 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  40.25 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  40.45 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  36.26 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.69 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  36.6 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  37.31 
 
 		 258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.6 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.08 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  36.88 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  34.21 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.11 
 
 		 458 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.5 
 
 		 458 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  37.36 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  36.12 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  35.41 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  35.63 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  35.63 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  40.07 
 
 		 258 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  38.55 
 
 		 261 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  38.38 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.54 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 		 259 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  33.97 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.34 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>