More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1931 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  100 
 
 
285 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  86.52 
 
 
283 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  78.57 
 
 
283 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  78.57 
 
 
283 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  80.53 
 
 
265 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  76.92 
 
 
264 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  63.32 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  64.34 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  63.32 
 
 
281 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  61.78 
 
 
256 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  60.15 
 
 
280 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  48.29 
 
 
295 aa  228  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  46.49 
 
 
276 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  48.31 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  45.71 
 
 
306 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  49.81 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  44.26 
 
 
307 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  47.53 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  44.83 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  46.32 
 
 
285 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  47.87 
 
 
309 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  45.42 
 
 
303 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  46.64 
 
 
322 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  45.95 
 
 
274 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41 
 
 
256 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  47.74 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  46.95 
 
 
274 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  45.59 
 
 
274 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  47.27 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  41 
 
 
255 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  41 
 
 
255 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  41 
 
 
255 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  41 
 
 
255 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  49.05 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  41 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  41 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.22 
 
 
255 aa  195  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  39.53 
 
 
303 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  38.85 
 
 
256 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  42.64 
 
 
317 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  39.85 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  40.39 
 
 
305 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  41.43 
 
 
374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.39 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  43.19 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  40.07 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.4 
 
 
464 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
258 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.39 
 
 
462 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35.88 
 
 
255 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.88 
 
 
255 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  39.62 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  40.23 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.79 
 
 
606 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  39.25 
 
 
259 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  35.66 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  36.23 
 
 
266 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.88 
 
 
256 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  40.77 
 
 
267 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  35.61 
 
 
255 aa  170  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 
257 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  38.2 
 
 
265 aa  169  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
263 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
260 aa  168  8e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 
260 aa  167  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  41.79 
 
 
258 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 
257 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.59 
 
 
257 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  39.29 
 
 
258 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.88 
 
 
256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  36.02 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  41.42 
 
 
258 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.85 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.63 
 
 
458 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  33.46 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  34.5 
 
 
256 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  35.88 
 
 
257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  41.04 
 
 
258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.54 
 
 
261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  35.88 
 
 
257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.38 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.85 
 
 
260 aa  162  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  38.72 
 
 
261 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0151  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 
276 aa  161  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  37.98 
 
 
269 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.25 
 
 
458 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  39.16 
 
 
261 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  37.98 
 
 
269 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  40.61 
 
 
261 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  37.31 
 
 
265 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  37.69 
 
 
265 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  35.32 
 
 
255 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  38.89 
 
 
267 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
263 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  38.17 
 
 
260 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>