More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13290 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 374 aa  756    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  56.31 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  57.24 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  51.8 
 
 		 305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  54.26 
 
 		 274 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  51.15 
 
 		 303 aa  252  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  48.24 
 
 		 310 aa  252  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  49.3 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  50.55 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  55.51 
 
 		 275 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  50 
 
 		 287 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  49.64 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  46.93 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  49.28 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  44.1 
 
 		 319 aa  229  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  47.22 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  44.67 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  41.86 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  43.93 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  45.26 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  45.96 
 
 		 274 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  44.22 
 
 		 286 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  45.24 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  42.75 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  43.91 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  42.3 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  44.85 
 
 		 256 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  43.62 
 
 		 280 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  42.12 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  46.91 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  46.91 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  42.07 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  41.75 
 
 		 328 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  41.58 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  47.1 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  40.29 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  42.57 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  44.14 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.68 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  37.77 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.9 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.9 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.78 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.97 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.19 
 
 		 256 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.3 
 
 		 458 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  37.01 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.3 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.26 
 
 		 268 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.81 
 
 		 257 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  38.18 
 
 		 259 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.46 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  31.8 
 
 		 262 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  34.11 
 
 		 263 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  36.17 
 
 		 462 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  38.08 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  38.06 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  33.92 
 
 		 269 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  36.13 
 
 		 262 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.02 
 
 		 606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  33.92 
 
 		 269 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  37.63 
 
 		 270 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  35.34 
 
 		 265 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  36.26 
 
 		 257 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  35.52 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  32.73 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  32.37 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  35.04 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  32.37 
 
 		 255 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 263 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  32.85 
 
 		 256 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  37.09 
 
 		 263 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  35.84 
 
 		 254 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  34.22 
 
 		 268 aa  143  5e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  35.85 
 
 		 280 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  31.18 
 
 		 262 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  35.4 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  34.09 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  36.13 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  31.18 
 
 		 255 aa  142  9e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  36.23 
 
 		 253 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.09 
 
 		 265 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  35.63 
 
 		 270 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  30.15 
 
 		 255 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  34.48 
 
 		 258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  34.56 
 
 		 268 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.87 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.12 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  38.97 
 
 		 267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.23 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.23 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.23 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.23 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.23 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.23 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>