More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1211 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  100 
 
 
295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  75.67 
 
 
301 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  60.52 
 
 
274 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  55.89 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  54.07 
 
 
272 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  51.16 
 
 
303 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  51.88 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  50.54 
 
 
276 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  52.65 
 
 
317 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  50.17 
 
 
303 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  49.67 
 
 
310 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  50.72 
 
 
374 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  48.66 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  49.12 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  46.83 
 
 
303 aa  252  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  52.09 
 
 
274 aa  252  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  52.27 
 
 
287 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  54.55 
 
 
275 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  52.33 
 
 
306 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  46.94 
 
 
322 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  47.75 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  49.05 
 
 
285 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  48.46 
 
 
274 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  45.1 
 
 
286 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  47.99 
 
 
283 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  47.99 
 
 
283 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  50.19 
 
 
280 aa  225  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  49.82 
 
 
328 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  47.53 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  46.01 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  45.14 
 
 
285 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  46.79 
 
 
265 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  45.95 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  42.75 
 
 
293 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  45.25 
 
 
264 aa  205  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  39.81 
 
 
319 aa  202  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  45.39 
 
 
274 aa  199  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  39.13 
 
 
326 aa  182  7e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  40.3 
 
 
256 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.74 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.88 
 
 
464 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
257 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.46 
 
 
462 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
255 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  34.09 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  33.46 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35.47 
 
 
457 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.44 
 
 
256 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.94 
 
 
256 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  35.38 
 
 
266 aa  149  4e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  36.74 
 
 
257 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 
253 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.63 
 
 
606 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  32.06 
 
 
257 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.72 
 
 
256 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.14 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  36.09 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  33.96 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  32.96 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  33.71 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  36.6 
 
 
461 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  35.85 
 
 
268 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 
258 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.98 
 
 
256 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  33.21 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.43 
 
 
258 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 
267 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.69 
 
 
256 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  37.93 
 
 
250 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  32.69 
 
 
255 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  34.7 
 
 
265 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 
270 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.36 
 
 
258 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
259 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  35.38 
 
 
262 aa  142  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  31.54 
 
 
255 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  31.92 
 
 
255 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  31.92 
 
 
255 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  35.71 
 
 
265 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.92 
 
 
255 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.48 
 
 
458 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.92 
 
 
255 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  31.92 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  38.87 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  29.48 
 
 
266 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  32.95 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  34.9 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  32.95 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  30.89 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.92 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  31.92 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  36.03 
 
 
254 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.89 
 
 
462 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.22 
 
 
458 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  36.09 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  36.23 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>