More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0643 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  68.38 
 
 		 285 aa  348  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  62.02 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  60.31 
 
 		 293 aa  308  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  61.39 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  60.62 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  60.62 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  60.62 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  60.31 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  62.2 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  59.62 
 
 		 264 aa  278  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  51.38 
 
 		 276 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  47.76 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  56.15 
 
 		 287 aa  234  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  47.39 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  52.53 
 
 		 274 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  50.76 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  50.95 
 
 		 317 aa  224  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  48.29 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  48.2 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  43.14 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.75 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  48.75 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.75 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.75 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  41.96 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.35 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.35 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.35 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  51.26 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.96 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  50.79 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  46.93 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.57 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  46.67 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.47 
 
 		 464 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  44.02 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  45.95 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  52.78 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  49.81 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  44.85 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  43.31 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  44.68 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  46.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  49.22 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  43.92 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  40.48 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.25 
 
 		 606 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  46.12 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  43.19 
 
 		 462 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  40 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  42.06 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  43.24 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  46.06 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  42.46 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.74 
 
 		 462 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.61 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  37.4 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  38.16 
 
 		 303 aa  184  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  47.64 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  40.84 
 
 		 458 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  40.46 
 
 		 458 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.29 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  42.13 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  44.4 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  43.97 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.86 
 
 		 256 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  38.43 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  40.79 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  40.7 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  36.36 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.7 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  38.71 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  38.67 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  39.22 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.7 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 461 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>