More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2730 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
305 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  61.64 
 
 
303 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  63.43 
 
 
310 aa  364  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  62.71 
 
 
303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  54.1 
 
 
303 aa  318  7e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  47 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  51.8 
 
 
374 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  53.38 
 
 
274 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  44.44 
 
 
326 aa  258  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  49.13 
 
 
287 aa  248  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  48.71 
 
 
317 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  49.3 
 
 
275 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  47.18 
 
 
307 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  48.25 
 
 
301 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  48.11 
 
 
306 aa  225  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  46.15 
 
 
295 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  42.95 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  46.15 
 
 
287 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  43.69 
 
 
272 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  41.37 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  47.83 
 
 
328 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  45.24 
 
 
322 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  44.44 
 
 
274 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  42.71 
 
 
274 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  42.9 
 
 
309 aa  205  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  40.91 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  41.18 
 
 
281 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  42.11 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  43.99 
 
 
280 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  39.86 
 
 
285 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  40.56 
 
 
283 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  40.46 
 
 
283 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  40.46 
 
 
283 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  40.07 
 
 
285 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  40.34 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  47.25 
 
 
274 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.42 
 
 
464 aa  165  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  39.79 
 
 
264 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.3 
 
 
256 aa  158  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.54 
 
 
462 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  31.69 
 
 
256 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.55 
 
 
462 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.69 
 
 
258 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 
293 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  39.1 
 
 
458 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.31 
 
 
606 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  37.98 
 
 
256 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.1 
 
 
458 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.78 
 
 
457 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  31.87 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.74 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  37.18 
 
 
271 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
461 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  34.43 
 
 
278 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  37.55 
 
 
269 aa  142  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.29 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.57 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.82 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  33.21 
 
 
255 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  38.38 
 
 
266 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.46 
 
 
256 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  33.56 
 
 
269 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  38.26 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.16 
 
 
255 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 
270 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  36.02 
 
 
257 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.09 
 
 
256 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.8 
 
 
255 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  31.4 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 
257 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  37.92 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  31.4 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  32.18 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.1 
 
 
255 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  30.53 
 
 
255 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  30.07 
 
 
257 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  36.36 
 
 
257 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  30.07 
 
 
257 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  30.99 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  30.74 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  36.99 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0721  hydrolase, TatD family  31.54 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00103897  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.39 
 
 
256 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  36.7 
 
 
265 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  31.1 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  31.1 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.1 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.1 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  30.74 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  28.52 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  32.52 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  36.68 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  35.29 
 
 
265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  33.21 
 
 
257 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  30.66 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.33 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  34.39 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  30.66 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>