More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0587 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 328 aa  661    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  61.89 
 
 		 307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  59.08 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  53.17 
 
 		 274 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  54.48 
 
 		 272 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  53.85 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  50.9 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  48.67 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  50.67 
 
 		 309 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  51.76 
 
 		 303 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  54.12 
 
 		 287 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  50.36 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  47.37 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  48.68 
 
 		 285 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  48.12 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  52.24 
 
 		 275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  54.62 
 
 		 274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  49.82 
 
 		 303 aa  239  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  47.44 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  50.18 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  49.82 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  42.37 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  49.26 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  47.37 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  44.63 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  42.55 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  40.66 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  51.52 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  44.31 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  44.75 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  46.51 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  40.73 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  40.73 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  43.97 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  41.04 
 
 		 265 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  43.48 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.15 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  39.54 
 
 		 264 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.33 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.43 
 
 		 256 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.36 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  33.33 
 
 		 266 aa  162  9e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.09 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  38.58 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 		 458 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  34.38 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  39.68 
 
 		 250 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.61 
 
 		 458 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.56 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.56 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  34.05 
 
 		 263 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  32.98 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.38 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.51 
 
 		 606 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  31.37 
 
 		 454 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  32.27 
 
 		 265 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  36 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.61 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  34.41 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  35.84 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  32.73 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.07 
 
 		 258 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  36.22 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  36.4 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  35.93 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  34.42 
 
 		 260 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  34.42 
 
 		 260 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  35.59 
 
 		 287 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  34.42 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  36.5 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  36.61 
 
 		 267 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  36.74 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  37.26 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.07 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  36.22 
 
 		 261 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  32.74 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  33.07 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0151  TatD-related deoxyribonuclease  38.08 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 273 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  36.46 
 
 		 273 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  34 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  36.47 
 
 		 258 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  32.27 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  31.7 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  32.97 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  33.45 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  38.57 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>