More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3965 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  80.66 
 
 		 274 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  60.57 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  57.69 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  57.45 
 
 		 286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  56.86 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  56.65 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  56.46 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  55.47 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  57.2 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  54.96 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  53.56 
 
 		 272 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  53.11 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  57.64 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  51.79 
 
 		 309 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  48.98 
 
 		 303 aa  251  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  52.11 
 
 		 295 aa  250  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  58.49 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  49.15 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  53.46 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  49.81 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  53.79 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  49.43 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  51.37 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  45.42 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  44.37 
 
 		 310 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  52.53 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  43.32 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  45.96 
 
 		 374 aa  215  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  46.64 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  46.64 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  45.45 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  46.12 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  47.13 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  46.72 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  43.97 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  34.59 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  44.23 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.91 
 
 		 464 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39.37 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  37.89 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.06 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.3 
 
 		 462 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.13 
 
 		 606 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  39.62 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.06 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.07 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  36.19 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  36.68 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  40.78 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.06 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  38.67 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.67 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  38.67 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  38.67 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  38.67 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.67 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.67 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  37.69 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  37.84 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  36.5 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  38.28 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  37.89 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.82 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 		 458 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.67 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  40.47 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  35.55 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  40.39 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  38.91 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  38.34 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.61 
 
 		 458 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  36.29 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  39.84 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  39.07 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.52 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  40.61 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35.8 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.8 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  40.39 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.55 
 
 		 462 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  42.25 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>