More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  66.31 
 
 		 274 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  57.77 
 
 		 303 aa  304  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  61.21 
 
 		 322 aa  285  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  56.93 
 
 		 274 aa  284  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  53.49 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  58.21 
 
 		 287 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  51.79 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  54.42 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  55.22 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  54.92 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  55.85 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  51.85 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  47.18 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  50.35 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  56.23 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  54.72 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  49.65 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  48.15 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  47.7 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  49.64 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  50.18 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  48.13 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  48.62 
 
 		 280 aa  231  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  48.51 
 
 		 285 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  48.3 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  48.21 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  47.86 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  47.86 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  47.57 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  43.17 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  37.16 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  49.47 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  45.56 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  39.18 
 
 		 319 aa  201  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.07 
 
 		 464 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  40.82 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.25 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  36.84 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.71 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.74 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  35.74 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.6 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  33.58 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.6 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  36.9 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  36.88 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  33.83 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.22 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.22 
 
 		 606 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  35.23 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.96 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.7 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  31.85 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.59 
 
 		 457 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  36.23 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  39.62 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.16 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.3 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  34.59 
 
 		 255 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  33.46 
 
 		 255 aa  156  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  34.59 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.43 
 
 		 458 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  35.85 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  36.12 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  36.23 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.59 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.59 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.21 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.21 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.21 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  32.45 
 
 		 454 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.21 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.21 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  34.47 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  37.59 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  36.36 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.08 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  34.08 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  34.72 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.21 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  34.33 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  36.74 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.27 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  36.74 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  36.74 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  36.74 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  38.49 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  36.74 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  36.74 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  35.82 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  36.74 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>