More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0768 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  100 
 
 
266 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  62.78 
 
 
266 aa  342  4e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  42.47 
 
 
255 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  42.47 
 
 
255 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  41.31 
 
 
255 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  40.15 
 
 
255 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  36.02 
 
 
262 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.93 
 
 
255 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.93 
 
 
255 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.93 
 
 
255 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.93 
 
 
255 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  37.55 
 
 
255 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  37.93 
 
 
255 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  37.93 
 
 
255 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.12 
 
 
257 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.55 
 
 
255 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  33.83 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  35.5 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.97 
 
 
256 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  37.16 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.78 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.72 
 
 
457 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  37.16 
 
 
256 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  38.02 
 
 
260 aa  182  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  35.25 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.78 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 
258 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  36.78 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.88 
 
 
256 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.02 
 
 
256 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  37.84 
 
 
255 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 
256 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  38.46 
 
 
265 aa  175  5e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  36.36 
 
 
258 aa  175  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.16 
 
 
265 aa  175  8e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  32.82 
 
 
261 aa  174  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  34.09 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.06 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.1 
 
 
255 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  35 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  31.92 
 
 
253 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.1 
 
 
258 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  35.38 
 
 
256 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  34.6 
 
 
256 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  34.87 
 
 
261 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  34.09 
 
 
264 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  35.07 
 
 
263 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  36.68 
 
 
263 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  31.18 
 
 
458 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  34.08 
 
 
264 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  34.7 
 
 
263 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  31.8 
 
 
256 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  34.2 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  34.98 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  37.07 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  34.98 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  35.14 
 
 
276 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  32.82 
 
 
253 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  32.44 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  35.88 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  31.03 
 
 
257 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  33.85 
 
 
258 aa  165  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  35.23 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  33.58 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  35.57 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  36.02 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  34.38 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  31.11 
 
 
462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  34.85 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  30.8 
 
 
458 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  33.72 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  35.36 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  34.2 
 
 
267 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  34.96 
 
 
262 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  30.6 
 
 
464 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  34.08 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  36.23 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  36.74 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  34.36 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  32.45 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  35.23 
 
 
258 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  33.72 
 
 
265 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  31.27 
 
 
259 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  34.87 
 
 
255 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  33.21 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
263 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  34.85 
 
 
282 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  33.08 
 
 
258 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  33.58 
 
 
265 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  36.57 
 
 
262 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  34.07 
 
 
269 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1551  Mg-dependent DNase  30.92 
 
 
274 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  31.3 
 
 
264 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  33.33 
 
 
264 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  35.63 
 
 
262 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>