More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1005 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  100 
 
 		 272 aa  550  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  56.43 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  53.26 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  57.58 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  53.31 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  52.26 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  57.25 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  54.81 
 
 		 274 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  54.75 
 
 		 274 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  52.85 
 
 		 276 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  51.65 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  53.87 
 
 		 317 aa  262  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  53.56 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  54.48 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  52.76 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  52.33 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  50.55 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  53.56 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  48.08 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  47.22 
 
 		 303 aa  238  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  49.06 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  45.36 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  48.86 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  43.97 
 
 		 374 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  43.69 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  50 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  50.76 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  40.21 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  52.89 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  49.43 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  48.3 
 
 		 283 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  47.37 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  35.47 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  40.46 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  40.17 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  44.15 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.55 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  33.84 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  44.15 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  33.84 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.56 
 
 		 464 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  37.64 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.59 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  35.71 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  42.02 
 
 		 462 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.12 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  36.92 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  43.18 
 
 		 258 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  36.5 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  38.84 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.23 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.02 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  36.88 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  36.26 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  37.02 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.23 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.12 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  37.02 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  37.02 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.64 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.26 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  37.6 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  37.55 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  38.76 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.56 
 
 		 606 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  36.78 
 
 		 261 aa  155  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  37.17 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.26 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.11 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  36.78 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.87 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  37.64 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 		 458 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 		 458 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  34.59 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.74 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  38.31 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  37.79 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.02 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  32.96 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  36.92 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  35.5 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  37.36 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  35.88 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  35.88 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.98 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  38.79 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  35.88 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  33.21 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>