More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3858 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  100 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  61.9 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  55.17 
 
 		 322 aa  288  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  57.35 
 
 		 309 aa  284  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  53.73 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  52.7 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  55.89 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  54.68 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  55.89 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  51.8 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  53.96 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  49.66 
 
 		 305 aa  255  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  49.15 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  55.64 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  56.06 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  50 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  51.71 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  53.03 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  47.06 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  50.9 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  52.9 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  48.68 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  45.04 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  54.31 
 
 		 280 aa  221  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  48.09 
 
 		 281 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  50.55 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  51.72 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  51.72 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  49.24 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  46.3 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.92 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  48.16 
 
 		 293 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  49.22 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  38.24 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  39.43 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  47.74 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  42.47 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  41.15 
 
 		 457 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  47.73 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.69 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  39.33 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  33.96 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.9 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.74 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.26 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.34 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.91 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.91 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  36.89 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.91 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.91 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  40.7 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 462 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.52 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  35.91 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.52 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 462 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.41 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.91 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  35.52 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  32.82 
 
 		 454 aa  163  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.14 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  34.75 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  38.76 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 458 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  41.82 
 
 		 269 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.45 
 
 		 606 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.23 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  39.16 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  40.24 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  35.63 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  34.62 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  34.62 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  41.06 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  42.75 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  41.45 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  35.77 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  37.98 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  42.75 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  35.32 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.31 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  39.11 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  40.65 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  40.65 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  40.65 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  42.37 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  38.2 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  35.95 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  35.51 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  38.78 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  38.13 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  39.46 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  39.84 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>