More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0766 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  100 
 
 		 274 aa  547  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  80.66 
 
 		 274 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  61.89 
 
 		 276 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  57.45 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  57.45 
 
 		 286 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  54.58 
 
 		 307 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  57.04 
 
 		 306 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  55.15 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  54.75 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  54.75 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  57.68 
 
 		 309 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  54.61 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  49.14 
 
 		 322 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  53.41 
 
 		 317 aa  246  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  57.36 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  48.3 
 
 		 303 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  54.22 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  52.55 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  52.9 
 
 		 275 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  48.46 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  47.44 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  52.47 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  43.92 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  48.25 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  48.88 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  42.44 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  51.57 
 
 		 256 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  43.91 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  44.91 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  44.91 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  47.19 
 
 		 281 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  41.34 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  45.08 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  44.19 
 
 		 283 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  37.55 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  43.23 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  40.93 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  38.52 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  42.19 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.23 
 
 		 464 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  35.53 
 
 		 319 aa  171  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  41.8 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  40.16 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  42.06 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  41.13 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  40 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  41.8 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  38.13 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  42.15 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  41.8 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  38.98 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  38.41 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  38.93 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.58 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  38.78 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.58 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  36.22 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  40.78 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  38.98 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  40.55 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  38.78 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  38.13 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  38.98 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  39.3 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  40.78 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 457 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  40.39 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  40.39 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  41.09 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  40.39 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  40.39 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  40.39 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  40.39 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  37.93 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  37.74 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  40.39 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  38.31 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  37.74 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  35.55 
 
 		 263 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  40 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  40 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  40 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  40.39 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.22 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  36.4 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  35.83 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.33 
 
 		 606 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  39.23 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>