More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0972 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  100 
 
 
303 aa  591  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  62.79 
 
 
303 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  62.71 
 
 
305 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  63.23 
 
 
310 aa  355  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  52.49 
 
 
303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  54.13 
 
 
374 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  53.38 
 
 
287 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  52.54 
 
 
274 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  44.13 
 
 
319 aa  255  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  51.93 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  48.99 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  48.08 
 
 
272 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  51.33 
 
 
309 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  46.44 
 
 
276 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  48.95 
 
 
317 aa  246  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  52.61 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  40.43 
 
 
326 aa  242  5e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  48.06 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  46.86 
 
 
285 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  49.82 
 
 
287 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  49.12 
 
 
274 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  46.2 
 
 
286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  53 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  47 
 
 
301 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  52.45 
 
 
328 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  47.16 
 
 
274 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  48.75 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  43.71 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  45.42 
 
 
285 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  47.12 
 
 
283 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  47.12 
 
 
283 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  45.96 
 
 
283 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  46.83 
 
 
265 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  46.88 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  44.21 
 
 
264 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  41.07 
 
 
285 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.3 
 
 
464 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  41.9 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  52.81 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.82 
 
 
256 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.29 
 
 
458 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.46 
 
 
256 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.95 
 
 
458 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.03 
 
 
258 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.4 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  30.53 
 
 
256 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 
256 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  30.53 
 
 
256 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 
457 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.28 
 
 
606 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.07 
 
 
256 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  31.67 
 
 
255 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.09 
 
 
462 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.21 
 
 
255 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  34.63 
 
 
271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.22 
 
 
462 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  34.4 
 
 
253 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  30.85 
 
 
255 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  30.85 
 
 
255 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  31.21 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.56 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  30.5 
 
 
255 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  30.5 
 
 
255 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  30.5 
 
 
255 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  30.5 
 
 
255 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  30.5 
 
 
255 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 
454 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  30.5 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  31.91 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  38.38 
 
 
268 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  30.14 
 
 
256 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  35.47 
 
 
282 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.5 
 
 
261 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  30.74 
 
 
255 aa  149  8e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.71 
 
 
255 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  35.64 
 
 
263 aa  148  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  30.28 
 
 
257 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.94 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  35.69 
 
 
273 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  32.02 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.94 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.57 
 
 
268 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  30.53 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  30.28 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.1 
 
 
256 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  29.8 
 
 
255 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  39.22 
 
 
265 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  31.79 
 
 
255 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  35.34 
 
 
257 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  34.04 
 
 
259 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.14 
 
 
256 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  33.77 
 
 
278 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.37 
 
 
255 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
256 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  33.08 
 
 
261 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  32.87 
 
 
271 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  34.65 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.8 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  35.29 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  40.21 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>