More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1043 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  66.31 
 
 		 287 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  58.06 
 
 		 287 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  59.77 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  54.04 
 
 		 276 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  58.62 
 
 		 301 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  56.44 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  54.42 
 
 		 303 aa  278  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  61.69 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  56.54 
 
 		 274 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  54.81 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  53.38 
 
 		 305 aa  270  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  50.7 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  50.69 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  57.33 
 
 		 322 aa  262  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  50.17 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  50.99 
 
 		 310 aa  260  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  55.04 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  52.54 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  52 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  50.53 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  54.04 
 
 		 374 aa  250  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  52.92 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  46.44 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  51.88 
 
 		 280 aa  224  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  48.31 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  42.48 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  49.81 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  47.46 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  47.6 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  46.99 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  38.87 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  44.15 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  48.34 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  48.34 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  47.21 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  47.83 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  44.98 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.31 
 
 		 464 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.38 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.85 
 
 		 462 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  38.29 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  36.68 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.61 
 
 		 458 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.61 
 
 		 458 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40 
 
 		 461 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.77 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.08 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.14 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.16 
 
 		 606 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.18 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.18 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.7 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  41.38 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.32 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.38 
 
 		 462 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.98 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  33.98 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  33.98 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.98 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.98 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  33.98 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  33.46 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  40.7 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  33.98 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  33.98 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  37.31 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  42.05 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.14 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  37.32 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  38.22 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.59 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  38.43 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  37.84 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  38.43 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  38.43 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.54 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  36.47 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  36.54 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  36.68 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  38.93 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.11 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  38.35 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  37.89 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  34.36 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  38.49 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  35 
 
 		 457 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>