More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4351 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  100 
 
 
283 aa  567  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  100 
 
 
283 aa  567  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  99.62 
 
 
265 aa  530  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  78.57 
 
 
285 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  79.92 
 
 
283 aa  407  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  78.38 
 
 
264 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  65.64 
 
 
293 aa  344  8.999999999999999e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  62.79 
 
 
285 aa  326  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  62.07 
 
 
281 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  60.62 
 
 
256 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  61.31 
 
 
280 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  47.78 
 
 
276 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  46.29 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  47.18 
 
 
285 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  49.81 
 
 
272 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  44.91 
 
 
286 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  46.77 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  44.41 
 
 
307 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  47.01 
 
 
287 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  48.36 
 
 
303 aa  208  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 
256 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  47.13 
 
 
274 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  46.77 
 
 
301 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  50.95 
 
 
287 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  46.3 
 
 
274 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  45.52 
 
 
317 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  48.34 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  47.43 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.77 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
255 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  50.6 
 
 
275 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.94 
 
 
255 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  41.34 
 
 
255 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  41.34 
 
 
255 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  40.94 
 
 
255 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.34 
 
 
255 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.34 
 
 
255 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.34 
 
 
255 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  44.68 
 
 
309 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.85 
 
 
255 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  40.94 
 
 
255 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  46.9 
 
 
374 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.34 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  40.54 
 
 
303 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  40.46 
 
 
305 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  41.3 
 
 
322 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  41.13 
 
 
328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.54 
 
 
464 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  40.14 
 
 
310 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.92 
 
 
257 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  36.98 
 
 
255 aa  177  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
257 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 
258 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.29 
 
 
256 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  37.93 
 
 
256 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  36.66 
 
 
319 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40 
 
 
259 aa  175  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  42.32 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  40.15 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  39.23 
 
 
257 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 
258 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
268 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 
258 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
263 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  36.4 
 
 
256 aa  169  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  34.6 
 
 
269 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  41.35 
 
 
258 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  41.06 
 
 
260 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.54 
 
 
256 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  37.79 
 
 
263 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  40.68 
 
 
258 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  34.48 
 
 
255 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.5 
 
 
257 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  41.2 
 
 
287 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.5 
 
 
257 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.08 
 
 
462 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  38.78 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  34.48 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  39 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.35 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  36.12 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  41.42 
 
 
263 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  36.98 
 
 
265 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.63 
 
 
458 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  40.98 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  37.92 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  39.33 
 
 
261 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.58 
 
 
256 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
263 aa  165  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  38.64 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  35.8 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  37.93 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.31 
 
 
606 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  34.5 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.34 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  39.16 
 
 
267 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 
263 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 
262 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  32.82 
 
 
260 aa  163  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.2 
 
 
256 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>