More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0151 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0151  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 276 aa  566  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1177  hydrolase TatD family  47.22 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00325246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  46.43 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.31 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.77 
 
 		 257 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  41.06 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  43.35 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  37.12 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  42.05 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  40.68 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  41.06 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  38.7 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  40.15 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  40.23 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  42.42 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  41.06 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  40.91 
 
 		 287 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 		 454 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  39.39 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  34.11 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  38.93 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  38.93 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  38.52 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  39.22 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  39.18 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  37 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  38.85 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  38.4 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  38.49 
 
 		 261 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  39.41 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.88 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  40.53 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  41.29 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  38.04 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  40.54 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  36.02 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.5 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.37 
 
 		 464 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  34.34 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  34.34 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  42.59 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  37.98 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  41.44 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  37.26 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  38.06 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  37.96 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  40.38 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  36.54 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  38.6 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  43.75 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  43.64 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  35.43 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.11 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 457 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  37.92 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  37.98 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  34.9 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  39.54 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  36.36 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.57 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  41.83 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  37.08 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  39.32 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.31 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  32.71 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  37.55 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  41.83 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.04 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  32.61 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  36.7 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  34.23 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  36.54 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  32.59 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  37.32 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  36.78 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.02 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  36.29 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  36.7 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  36.7 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  36.7 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  37.31 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  38.72 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  38.72 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>