More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0528 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0528  hydrolase, TatD family  100 
 
 
266 aa  525  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  43.68 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  42.25 
 
 
257 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.86 
 
 
261 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.6 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  41.8 
 
 
258 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.98 
 
 
257 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  38.58 
 
 
260 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  38.72 
 
 
260 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  38.35 
 
 
260 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.61 
 
 
257 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  35.91 
 
 
255 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
459 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  38.35 
 
 
260 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  37.78 
 
 
267 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  40.77 
 
 
267 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  39.85 
 
 
273 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  36.23 
 
 
261 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  37.26 
 
 
257 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.22 
 
 
457 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  42.24 
 
 
250 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.23 
 
 
255 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  38.31 
 
 
258 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  35.63 
 
 
260 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  36.98 
 
 
261 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  41.29 
 
 
263 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.61 
 
 
464 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  39.16 
 
 
264 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.64 
 
 
263 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 
270 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  41.7 
 
 
270 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  42.15 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.23 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.23 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.23 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  39.08 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.23 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.61 
 
 
255 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.45 
 
 
256 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.23 
 
 
257 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.23 
 
 
257 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  42.15 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.85 
 
 
255 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  37.36 
 
 
263 aa  151  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  40.61 
 
 
258 aa  151  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  35.23 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.85 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  35.25 
 
 
258 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  44.9 
 
 
268 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30.27 
 
 
256 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.08 
 
 
256 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  37.26 
 
 
263 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.47 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 
256 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  38.76 
 
 
259 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  41.86 
 
 
271 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.35 
 
 
256 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  33.59 
 
 
258 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  43.35 
 
 
285 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.23 
 
 
255 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  31.4 
 
 
255 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  34.1 
 
 
258 aa  148  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.47 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  41.38 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  33.21 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  36.6 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.78 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  39.42 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  33.72 
 
 
256 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  37.88 
 
 
261 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  33.58 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  34.96 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  36.09 
 
 
269 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  35.36 
 
 
255 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  36.6 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.39 
 
 
261 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.47 
 
 
264 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  36.03 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 
256 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  41.06 
 
 
259 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  38.84 
 
 
272 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
262 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  37.06 
 
 
266 aa  144  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  37 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  37 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  37 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  37 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  37 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  37 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  35.09 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  37 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  40.36 
 
 
264 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  39.38 
 
 
264 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.22 
 
 
256 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
265 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.38 
 
 
606 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>