More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1052 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  99.25 
 
 		 268 aa  552  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  76.23 
 
 		 267 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  76.81 
 
 		 270 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  55.26 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  57.47 
 
 		 287 aa  275  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  51.32 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  53.16 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  52.79 
 
 		 278 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  53.58 
 
 		 265 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  52.45 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  53.58 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  53.03 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  54.92 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  49.05 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  51.72 
 
 		 266 aa  258  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  53.73 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  48.26 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  47.49 
 
 		 260 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  47.88 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  47.88 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  47.88 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  47.88 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  45.8 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  54.55 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  47.49 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  45.8 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  45.8 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 267 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  45.8 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  53.79 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  46.36 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  50.92 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  45 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  44.91 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  46.15 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  46.33 
 
 		 260 aa  242  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  46.33 
 
 		 260 aa  242  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  46.33 
 
 		 260 aa  242  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  46.21 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  46.33 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  49.17 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  45.95 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  45.95 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  44.19 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  45.95 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  47.49 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  45.38 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  46.33 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  46.01 
 
 		 264 aa  234  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  45.38 
 
 		 264 aa  234  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  46.15 
 
 		 264 aa  234  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  46.33 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  42.53 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 262 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.92 
 
 		 464 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  39.25 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.1 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  40.84 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  36.09 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  34.72 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  40.8 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.74 
 
 		 459 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  38 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  38 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.15 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.61 
 
 		 462 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.88 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.82 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  38.52 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  34.36 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  37.74 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.22 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.6 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.97 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  33.96 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  35 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  34.34 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  36.78 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  36.78 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.78 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  32.05 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.57 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.56 
 
 		 458 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.37 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 462 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0103  TatD family hydrolase  31.73 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0970628  normal  0.125784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>