105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0115 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  100 
 
 		 398 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  52.99 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  57.71 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  35.7 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  41.84 
 
 		 391 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  40.1 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  39.09 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  34.55 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  31.63 
 
 		 492 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  34.38 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  39.18 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  37.5 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  38.25 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  37.24 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  39.01 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  36.56 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  35.24 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  34.65 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  33.33 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  36.22 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  36.76 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  25.79 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  36.22 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  32.81 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  34.69 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  30.74 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  32.49 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  30.26 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  31.63 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  34.81 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  34.81 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  32.12 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  34.81 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  30.65 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32.23 
 
 		 410 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  31.12 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31.17 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  30.61 
 
 		 445 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  30.81 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  29.95 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  30.46 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  30.35 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  27.5 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  27.23 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  25.07 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  25.34 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  29.78 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  27.42 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  25.82 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  28.65 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  25.71 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  26.74 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  24.06 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  26.69 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  25.64 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  26.15 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  27.27 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  25.95 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  26.27 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  26.01 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  26.01 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  25.88 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  25.44 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  26.83 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  26.29 
 
 		 459 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  25 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  27.2 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  25.36 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  26.16 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  26.18 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  25.91 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  24 
 
 		 459 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  24.29 
 
 		 402 aa  53.1  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  21.71 
 
 		 426 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  25.28 
 
 		 335 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  23.9 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  26 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  31.06 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  25 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  26.21 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  24.9 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  26.06 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  25.91 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  29.12 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  25.4 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  24.02 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  27.59 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  24.47 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  25.53 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  22.56 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  21.24 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  21.24 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  23.37 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5547  conjugation TrbI family protein  27.54 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  25.39 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  21.26 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  25.82 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  25.52 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  26.09 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  25.54 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>