146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5237 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  100 
 
 		 483 aa  970    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  42.99 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  41.3 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  31.08 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  45.95 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  45.95 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  42.7 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  40.21 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  40.31 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  40.31 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  39.79 
 
 		 472 aa  140  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  38.5 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  43.16 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  40.22 
 
 		 446 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5547  conjugation TrbI family protein  41.15 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167146 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  38.14 
 
 		 437 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  38.54 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  37.62 
 
 		 447 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  37.62 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  32.48 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  40.11 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  36.89 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  38.54 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  34.01 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  37.11 
 
 		 437 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  35.53 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  36.68 
 
 		 335 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  35.9 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  36.11 
 
 		 430 aa  123  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  39.25 
 
 		 392 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  37.19 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  35.75 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  35.34 
 
 		 400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  34.87 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  34.5 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  35 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  33.76 
 
 		 373 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  35.94 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  39.89 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  37.63 
 
 		 400 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  37.23 
 
 		 383 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  34.76 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  36.19 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  34.68 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  37.06 
 
 		 465 aa  113  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  34.55 
 
 		 405 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  31.11 
 
 		 396 aa  113  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  35.64 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  37.76 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  34.62 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  35.35 
 
 		 388 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  37.24 
 
 		 418 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  37.37 
 
 		 414 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  37.24 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  35.86 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.81 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  34.55 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  34 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  35.11 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  35.11 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  37.31 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  35.79 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  29.04 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  35.26 
 
 		 422 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  34.36 
 
 		 391 aa  107  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  34.87 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  35.08 
 
 		 411 aa  107  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  35.26 
 
 		 423 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  34.76 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  34.92 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  34.74 
 
 		 427 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  37.06 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  33.68 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  34.58 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  33.17 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  37.06 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  34.21 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  33.82 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 423 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  36.26 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  33.68 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  35.53 
 
 		 412 aa  100  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  33.33 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  33.68 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  33.68 
 
 		 423 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 408 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  34.25 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  31.82 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 427 aa  97.8  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  34.5 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  33.73 
 
 		 190 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  32.96 
 
 		 459 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  31.31 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  32.4 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  31.16 
 
 		 384 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  40 
 
 		 379 aa  93.6  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>