146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2359 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  91.8 
 
 
425 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  85.98 
 
 
423 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  86.21 
 
 
422 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  95.08 
 
 
427 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  84.81 
 
 
423 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  91.1 
 
 
426 aa  759    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  85.45 
 
 
420 aa  689    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  79.4 
 
 
427 aa  663    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  88.76 
 
 
425 aa  711    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  85.65 
 
 
423 aa  707    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  84.42 
 
 
424 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  85.51 
 
 
422 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  100 
 
 
427 aa  850    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  86.71 
 
 
423 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  85.78 
 
 
424 aa  729    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  86.88 
 
 
379 aa  620  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  75.17 
 
 
439 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  66.11 
 
 
412 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  46.46 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  46.33 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  45.13 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  44.55 
 
 
400 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  44.71 
 
 
399 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  44.8 
 
 
394 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  44.8 
 
 
394 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  45.69 
 
 
402 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  43.84 
 
 
421 aa  288  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  44.39 
 
 
396 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  42.65 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  44.58 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  42.32 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  43.53 
 
 
418 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  41.88 
 
 
414 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  43.39 
 
 
388 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  42.75 
 
 
405 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  44.31 
 
 
391 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  40.09 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  43.52 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  43.36 
 
 
383 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  42.55 
 
 
400 aa  268  8.999999999999999e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  44.08 
 
 
375 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  42.05 
 
 
392 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  42.82 
 
 
400 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  43.11 
 
 
373 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  41.87 
 
 
415 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  40.14 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  40.05 
 
 
388 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  42.11 
 
 
335 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  39.56 
 
 
393 aa  249  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  38.93 
 
 
398 aa  239  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  37.53 
 
 
430 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  39.85 
 
 
386 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  38.2 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  38.23 
 
 
384 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  41.67 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  39.39 
 
 
395 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  47.03 
 
 
428 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  41.52 
 
 
418 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  32.29 
 
 
410 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  38.13 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  38.28 
 
 
426 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  45.26 
 
 
408 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  39.48 
 
 
430 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  39.91 
 
 
437 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  39.13 
 
 
431 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  39.48 
 
 
437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  38.18 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  42.63 
 
 
445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  38.73 
 
 
466 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  38.46 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  45.14 
 
 
190 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  37 
 
 
472 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  37 
 
 
473 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  37 
 
 
473 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  33.19 
 
 
490 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  35.23 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  32.12 
 
 
467 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  36.96 
 
 
410 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  35.68 
 
 
447 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  35.68 
 
 
447 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 
403 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 
403 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  33.52 
 
 
414 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  34.87 
 
 
444 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  33.15 
 
 
403 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  32.64 
 
 
422 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  33.68 
 
 
483 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  31.19 
 
 
486 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  31.19 
 
 
469 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  35.11 
 
 
402 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  33.88 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  27.02 
 
 
457 aa  95.5  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  32.47 
 
 
440 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  36.41 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  33.21 
 
 
444 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  28.05 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  34.38 
 
 
450 aa  90.1  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  28.03 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>