143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2276 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 384 aa  729    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  45.23 
 
 		 411 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  44.88 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  42.61 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  46.73 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  44.79 
 
 		 421 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  45.62 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  42.25 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  43.44 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  43.56 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  44.36 
 
 		 388 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  43.78 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  46.36 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  42.46 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  42.46 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  43.19 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  44.24 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  45.26 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  42.32 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  41.84 
 
 		 401 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  42.78 
 
 		 411 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  42.6 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  41.85 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  44.13 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  44.03 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  43.64 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  44.73 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  41.94 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  40.31 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  37.65 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  37.84 
 
 		 422 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  38.27 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  38.69 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  38.11 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  57.29 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  37.03 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  38.23 
 
 		 427 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  37.34 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  51.47 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  37.44 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  35.32 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  37.69 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  40.26 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  39.9 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  36.86 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  37.92 
 
 		 439 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  37.34 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  37.24 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  37.35 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  55.72 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  37.1 
 
 		 427 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  45.23 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  44.4 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  47.94 
 
 		 425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  46.09 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  36.68 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  35.1 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  45.02 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  38.07 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  39.18 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  38.97 
 
 		 430 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  35.93 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  39.06 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  38.24 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  36.55 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  39.49 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  36.55 
 
 		 473 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  36.55 
 
 		 473 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  34.11 
 
 		 459 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  36.36 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  37.43 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  36.36 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  33.18 
 
 		 466 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  35.86 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  32.21 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  31.25 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  34.09 
 
 		 190 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  36.26 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  35.24 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  36.26 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  36.04 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  35.53 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  35.68 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  31.88 
 
 		 446 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  33.65 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  33.16 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  35.03 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  30.81 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  30.27 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  34.52 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  33.87 
 
 		 432 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  30.92 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  30.53 
 
 		 444 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  31.16 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  30.77 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  30.77 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  31.05 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  32.97 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  30.53 
 
 		 459 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  31.05 
 
 		 447 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>