147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2315 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  100 
 
 		 396 aa  787    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  77.56 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  77.44 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  75.53 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  75.53 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  70.15 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  69.9 
 
 		 401 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  69.19 
 
 		 411 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  75.86 
 
 		 375 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  76.22 
 
 		 383 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  66.08 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  71.09 
 
 		 373 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  68.03 
 
 		 391 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  69.77 
 
 		 388 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  66.5 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  66.24 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  68.87 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  65.82 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  61.88 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  60.26 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  60.53 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  57.03 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  58.29 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  55.28 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  54.66 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  56.04 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  58.63 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  52.51 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  54.38 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  50.51 
 
 		 392 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  52.01 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  48.94 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  47.33 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  44.28 
 
 		 423 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  44.86 
 
 		 424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  44.97 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  45.14 
 
 		 426 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  43.94 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  42.54 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  44.14 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  43.72 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  45.34 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  43.44 
 
 		 384 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  42.82 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  42.3 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  44.14 
 
 		 427 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  43.06 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  43.17 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  43.5 
 
 		 425 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  38.74 
 
 		 431 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  39.61 
 
 		 439 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  48.49 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  41.34 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  40.89 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  40.69 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  38.24 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  42.54 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  38.48 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  42.22 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  31.74 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  38.08 
 
 		 433 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  41.83 
 
 		 437 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  41.33 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  46.6 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  33.94 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  43.08 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  43.08 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  42.05 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  38.03 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  38.25 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  35.98 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  37.1 
 
 		 439 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  36.23 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  33.8 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  41.86 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  80.25 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  32.92 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  37.1 
 
 		 446 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  34.24 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  34.24 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  31.11 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  35.48 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  36.73 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  31.92 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  36.73 
 
 		 469 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  34.74 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  36.32 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  33.68 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  36.96 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  35.5 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  29.5 
 
 		 363 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  36.96 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  33.71 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  33.71 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  28.8 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  31.94 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  30.69 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  30.92 
 
 		 457 aa  97.4  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>