140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0735 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  88.95 
 
 		 426 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 379 aa  747    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  86.35 
 
 		 427 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  83.46 
 
 		 424 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  86.88 
 
 		 427 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  87.11 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  82.89 
 
 		 423 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  85.26 
 
 		 422 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  83.2 
 
 		 423 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  81.58 
 
 		 423 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  83.25 
 
 		 424 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  81.58 
 
 		 423 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  81.84 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  83.2 
 
 		 420 aa  587  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  84.47 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  76.36 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  72.21 
 
 		 439 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  63.78 
 
 		 412 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  45.68 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  45.4 
 
 		 402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  41.84 
 
 		 411 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  44.96 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  42.97 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  44.21 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  44.21 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  43.31 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  44.47 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  42.23 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  43.09 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  43.44 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  41.15 
 
 		 411 aa  236  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  40.8 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  39.75 
 
 		 431 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  42.08 
 
 		 399 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  41.14 
 
 		 414 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  41.18 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  40.44 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  40.53 
 
 		 418 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  41.85 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  42.59 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  42.15 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  42.74 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  40.88 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  44.07 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  39.72 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  39.12 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  39.1 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  38.52 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  39.05 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  36.8 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  39.08 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  40.96 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  35.2 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  38.57 
 
 		 397 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  38.2 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  34.4 
 
 		 410 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  41.06 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  46.06 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  41.82 
 
 		 439 aa  149  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  45.2 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  40.2 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  40.78 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  43.75 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  43.18 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  45.4 
 
 		 408 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  43.95 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  42.75 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  34.82 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  44.44 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  44.44 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  44.44 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  43.48 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  34.9 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  44.06 
 
 		 190 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  38.58 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  35.71 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.41 
 
 		 410 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  35.76 
 
 		 403 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  38.52 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  38.93 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  43.97 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  36.91 
 
 		 469 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  40 
 
 		 483 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  42.02 
 
 		 447 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31.34 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  42.02 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  40.87 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  40.87 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  38.21 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  36 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  39.02 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  41.38 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  37.13 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  28.5 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  35.65 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  34.42 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  36.11 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  35.2 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  36.52 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>