148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1508 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  100 
 
 		 392 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  63.35 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  59.02 
 
 		 411 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  59.74 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  55.78 
 
 		 402 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  53.45 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  55 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  51.49 
 
 		 394 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  51.49 
 
 		 394 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  51.78 
 
 		 402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  52.05 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  49.87 
 
 		 414 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  53.73 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  50.25 
 
 		 401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  50.12 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  50.77 
 
 		 411 aa  348  9e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  54.6 
 
 		 335 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  50.51 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  50.78 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  49.61 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  49.61 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  49.74 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  50.63 
 
 		 415 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  50.65 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  49.47 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  48.57 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  48.8 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  47.38 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  48.43 
 
 		 373 aa  309  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  43.58 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  44.95 
 
 		 430 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  43.97 
 
 		 423 aa  279  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  43.66 
 
 		 427 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  44.14 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  42.46 
 
 		 424 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  42.65 
 
 		 422 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  42.21 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  40.38 
 
 		 423 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  42.17 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  42 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  42.18 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  41.15 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  42.54 
 
 		 427 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  42.5 
 
 		 425 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  44.08 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  41.46 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  41.43 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  40.2 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  41.73 
 
 		 425 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  42.68 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  41.58 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  35.87 
 
 		 431 aa  223  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  41.79 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  37.76 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  37.41 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  47.44 
 
 		 428 aa  203  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  40.31 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  39.07 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  34.91 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  51.05 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  47.78 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  42.33 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  41.86 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  39.34 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  42.33 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  40.47 
 
 		 437 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  39.57 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  39.57 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  39.57 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  39.45 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  38.16 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  35.22 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  39.32 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  43.6 
 
 		 190 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  39.44 
 
 		 490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  33.78 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  35.19 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  40.72 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  41.49 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  39.25 
 
 		 483 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  36.41 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  42.55 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  36.07 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  36.07 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  38.67 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  37.11 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  36.87 
 
 		 486 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  35.57 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  35.83 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  37.11 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  35.05 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  35.79 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  31.73 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  34.2 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  35.07 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  31.33 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  32.84 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  34.76 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  33.68 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  38.5 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>