147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0178 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  748    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  93.94 
 
 		 363 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.19 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  39.64 
 
 		 410 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  38.91 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  39.64 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  39.22 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  38.58 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  31.7 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  36.02 
 
 		 445 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  40.21 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  37.89 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  39.67 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  39.77 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  38.12 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  35.15 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  31.84 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  36.96 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  30.67 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  35.52 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  30.2 
 
 		 459 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  29.8 
 
 		 459 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  37.67 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  34.69 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  29.8 
 
 		 459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  37.57 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  31.13 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  36.53 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  34.27 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  29.84 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  35.62 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  32.11 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  33.02 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  29.63 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  32.11 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  33.8 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  33.49 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  28.7 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  33.88 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  30.26 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  34.43 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  31.33 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  30.93 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  28.1 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  28.31 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  28.88 
 
 		 391 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  34.31 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  29.09 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  33.49 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  32.54 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  33.82 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  30.26 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  33.49 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  27.59 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  33.49 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  32.72 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  33.65 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  32.06 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  28.99 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  30.48 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  29.45 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  29.45 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  27.37 
 
 		 447 aa  93.6  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  32.56 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  29.95 
 
 		 446 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  30.96 
 
 		 467 aa  92.8  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  29.35 
 
 		 445 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  29.52 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  30.65 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  31.52 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  29.79 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  33.52 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  31.53 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  31.84 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  31.15 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  40.57 
 
 		 486 aa  90.5  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  30.65 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  29.52 
 
 		 457 aa  90.1  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  29.38 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  32.42 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  29.24 
 
 		 472 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  29.24 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  30.65 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  28.21 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  29.24 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  31.49 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  29.65 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  28.88 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  28.71 
 
 		 459 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  32.27 
 
 		 483 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  31.18 
 
 		 490 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  31.87 
 
 		 453 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  27.92 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  30.28 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  30.49 
 
 		 399 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  30.67 
 
 		 418 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>