142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0015 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  100 
 
 		 380 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  37.81 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  31.11 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  41.36 
 
 		 453 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  41.05 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  38.37 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  41.62 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  40 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  39.78 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  38.92 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  35.08 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  37.5 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  33.16 
 
 		 390 aa  136  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  31.94 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  27.49 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  31.86 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  38.04 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  34.9 
 
 		 484 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  35.83 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  34.72 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  34.54 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  32.59 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  33.02 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  35 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  34.74 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  31.77 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  34.21 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  32.64 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31.77 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  29.46 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  33.51 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  31.58 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  34.55 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.29 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  32.49 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  31.84 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  32.07 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  29.55 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  34.21 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  30.65 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  31.52 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  30.89 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  27.81 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  29.74 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  28.04 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  28.35 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  28.57 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  25.33 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  28.49 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  27.93 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  31.15 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  27.4 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  25.79 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  30.37 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  30.37 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  29.38 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  29.44 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  23.9 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  25.28 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  31.15 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  25.77 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  27.14 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  29.51 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  28.18 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  29.28 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  27.81 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  29.79 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  28.18 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  29.63 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  28.98 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  27.62 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  26.64 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  27.14 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  27.62 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  26.73 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  27.78 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  26.73 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  28.5 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  26.73 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  21.23 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  26.4 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  27.62 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  27.04 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  26.19 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  26.53 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  26.53 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  27.62 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  24.46 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  27.81 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  25.51 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  27.27 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  27.51 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  26.88 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  29.95 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  27.84 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  28.73 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  27.27 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>