143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5367 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 418 aa  820    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  42.21 
 
 		 408 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  39.66 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  39.66 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  40.36 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  55.15 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  39.66 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  44.37 
 
 		 335 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  36.25 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  39.13 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  40.3 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  40.05 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  36.74 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  39.12 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  37.44 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  37.31 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  38.48 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  40.6 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  38.73 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  38.15 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  39.03 
 
 		 402 aa  202  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  36.25 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  38.28 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  35.97 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  36.14 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  36.63 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  47.58 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  49.07 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  39.9 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  39.85 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  41.45 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  39.59 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  46.94 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  45.83 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  37.19 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  38.31 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  35.51 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  46.3 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  37.14 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  38.92 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  40.88 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  45.37 
 
 		 422 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  38.75 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  48.91 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  36.73 
 
 		 388 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  38.31 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  36.01 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  38.74 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  48.7 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  33.97 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  47.94 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  48.45 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  48.42 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  39.63 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  47.42 
 
 		 393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  45.04 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  37.92 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  48.15 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  38.85 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  36.15 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  48.39 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  42.6 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  42.6 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  42.08 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  32.08 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  37.42 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  37.5 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  39.74 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  43.39 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  39.07 
 
 		 466 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  35.39 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  32.61 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  44.32 
 
 		 190 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  36.32 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  34.25 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  35.32 
 
 		 490 aa  137  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  30.81 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  38.42 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  31.41 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  32.99 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  31.28 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  30.32 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  30.32 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  31.28 
 
 		 469 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  36.41 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  28.52 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  31.07 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  31.97 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  30 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  40.13 
 
 		 445 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.62 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  34.3 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  28.11 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  29.05 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32.09 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  41.14 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  33.5 
 
 		 447 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  30.67 
 
 		 363 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  33.5 
 
 		 447 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  39.16 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>