147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7750 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  100 
 
 		 399 aa  779    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  77.44 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  78.66 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  76.32 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  76.32 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  76.68 
 
 		 401 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  75.91 
 
 		 401 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  75.71 
 
 		 411 aa  542  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  74.87 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  73.51 
 
 		 375 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  69.85 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  68.29 
 
 		 421 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  71.02 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  67.97 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  65.32 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  65.06 
 
 		 414 aa  471  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  66.24 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  61.14 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  64.97 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  62.34 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  60.2 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  59.39 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  58.03 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  57.58 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  58.18 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  55.03 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  59.35 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  54.94 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  50.12 
 
 		 392 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  54.91 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  51.45 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  49.11 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  43.57 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  46.32 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  42.36 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  44.39 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  43.88 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  42.59 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  44.15 
 
 		 423 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  42.13 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  44.44 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  42.92 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  42.73 
 
 		 424 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  44.02 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  41.94 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  40.96 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  41.86 
 
 		 427 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  43.71 
 
 		 425 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  42.26 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  42.58 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  47.55 
 
 		 399 aa  268  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  43.26 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  40.62 
 
 		 412 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  40.35 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  41.22 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  38.84 
 
 		 428 aa  202  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  38.48 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  43.59 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  34.14 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  48.51 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  39.04 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  42.11 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  40.71 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  40.85 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  40.79 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  38.43 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  42 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  42 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  42 
 
 		 472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  37.84 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  38.5 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  36.53 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  38.01 
 
 		 439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  35.78 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  36.82 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  33.96 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  40.45 
 
 		 190 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  80.25 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  39.07 
 
 		 422 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  35 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  34.41 
 
 		 446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  31.16 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  33.15 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  33.15 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 469 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  32.98 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  33.48 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  31.61 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  33.87 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  33.87 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.05 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  31.13 
 
 		 440 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.22 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  27.82 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 		 447 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  34.78 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  29.84 
 
 		 444 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>