144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0006 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  100 
 
 		 486 aa  971    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  39.62 
 
 		 447 aa  199  9e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  39.94 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  31.31 
 
 		 457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  31.03 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  45.71 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  47.75 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  34.62 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  36.18 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  51 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  37.91 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  35.67 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  38.4 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  35.09 
 
 		 381 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  32.45 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  46 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  33.33 
 
 		 373 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  35.06 
 
 		 381 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  40.57 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  31.79 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  35.66 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  30.23 
 
 		 363 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  36.72 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 472 aa  86.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  34.65 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  37.5 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  25 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  31.97 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  36.61 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  53 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  38.28 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  38.02 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  34.29 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  31.29 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  34.29 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  33.63 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  34.1 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  39.39 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  38.93 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  36.44 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  41.13 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  33.94 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  35.59 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  26.43 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  36.8 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  38.21 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  34.73 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  26.92 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  39.02 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  33.55 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  36.76 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  29.12 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  33.33 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  24.49 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  34.55 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  39.13 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  27.61 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  36 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  27.61 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  37.12 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  36.67 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  35.29 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  35.2 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  34.97 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  32.14 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  32.48 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  33.05 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  41 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  40.4 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  31.11 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  33.05 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  31.72 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  30.47 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  43.3 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  36.96 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  37.58 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  32.93 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  38.66 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  41.41 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  40 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  39.39 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  39.32 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  32.93 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  38.98 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  34.68 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  36.97 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  32.93 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  39.32 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  40.4 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  42.42 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  31.58 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  38.14 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  39.32 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  33.94 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>