147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4556 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 410 aa  826    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  71.08 
 
 		 403 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  68.37 
 
 		 402 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  64.22 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  47.23 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  39.63 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  38.7 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  38.94 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  38.6 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  36.48 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  34.91 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  35.15 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  38.5 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  31.1 
 
 		 378 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  38.5 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  40.11 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  38.34 
 
 		 437 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  33.2 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  35.32 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  35.47 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  34.98 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  40.43 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  34.98 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  32.68 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  35.75 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  31.3 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  39.68 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  33.02 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  31.98 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  36.36 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  36.11 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  37.67 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  33.67 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  30.8 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  35.57 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  34.2 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  32.54 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  33.68 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  36.16 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  33.67 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  33.68 
 
 		 473 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  33.68 
 
 		 473 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  35.43 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  33.19 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  32.52 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  34.1 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  33.93 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  29.92 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  32 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  31.63 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  32.64 
 
 		 484 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 439 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  32.33 
 
 		 423 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  34.56 
 
 		 426 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  35.64 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  29.43 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  30 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  34.1 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  34.1 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  36.61 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  31.79 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  35.64 
 
 		 335 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  34.1 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  32.87 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  37.43 
 
 		 425 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  32.88 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  34.92 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  34.56 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  36.42 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  34.8 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  35.14 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  35.02 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  37.97 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  33.67 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  35.75 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  34.04 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  35.83 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  35.03 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  33.64 
 
 		 427 aa  106  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  31.9 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  32.81 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  31.28 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  34.48 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  35.26 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  34.65 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  35.23 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  35.23 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  33.16 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  35.42 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  30.49 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  31.36 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  35.78 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 407 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>