147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3528 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 378 aa  767    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  43.53 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  43.53 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  43.18 
 
 		 391 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  37.57 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  41.67 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  41.42 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  38.85 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  39.92 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  36.57 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  39.42 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  40 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  38.89 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  36.6 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  41.79 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  37.82 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  40.62 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  41.76 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  42.19 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  31.41 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  31.07 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  30.86 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  38.54 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  31.67 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  35.98 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  34.53 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  35.78 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  39.06 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  39.06 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  38.54 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  32.21 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  38.07 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  31.7 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  29.69 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.98 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  35.6 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  37.96 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  35.78 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  35.9 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  31.86 
 
 		 380 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  31.7 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  34.63 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  34.2 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  32.8 
 
 		 459 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  29.88 
 
 		 459 aa  122  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  29.46 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  30.58 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  32.49 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  31.96 
 
 		 472 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  30.53 
 
 		 437 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  31.96 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  31.96 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  31.02 
 
 		 466 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 430 aa  99.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  31.49 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  29.41 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  30.04 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  29.82 
 
 		 423 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  31.1 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  35.9 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  29.29 
 
 		 426 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  28 
 
 		 422 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  32.56 
 
 		 386 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  31.25 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  27.54 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  28.95 
 
 		 425 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  29.39 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  29.39 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  30.37 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  28.99 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  29.29 
 
 		 433 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  28.95 
 
 		 422 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  29.28 
 
 		 423 aa  93.2  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  31.03 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  28.95 
 
 		 439 aa  92.8  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  31.82 
 
 		 415 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  29.85 
 
 		 421 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  26.9 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  30 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  28.1 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  28.63 
 
 		 424 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  29.52 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  28.95 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  29.07 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  27.11 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  29.21 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  28.51 
 
 		 420 aa  89.7  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  27.46 
 
 		 459 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  30.88 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  30.29 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  29.95 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  28.57 
 
 		 430 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  28.65 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  30.67 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  28.07 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  27.84 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  28.51 
 
 		 445 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  27.69 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  30.34 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>