147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08206 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  100 
 
 		 397 aa  818    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  42.23 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  30.49 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  37.77 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  42.86 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  43.55 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  43.01 
 
 		 391 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  42.33 
 
 		 450 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  42.78 
 
 		 391 aa  152  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  41.88 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  40.74 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  40.21 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  38.38 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  39.09 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  37.57 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  37.88 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  38.1 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  39.34 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  38.62 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  38.62 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  38.92 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  37.23 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  37.04 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  38.1 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  35.44 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  31 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  35.83 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  35.2 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  36.56 
 
 		 391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  31.96 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  37.16 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  35.71 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  34.65 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  37.77 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  32.02 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.08 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  31.63 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  28.74 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  31.6 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  34.72 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  29.24 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  30.16 
 
 		 437 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  32.28 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  31.22 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  29.05 
 
 		 444 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  32.64 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  31.87 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  32.09 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  32.29 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  31.41 
 
 		 473 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  31.41 
 
 		 473 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  29.31 
 
 		 459 aa  92.8  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  30.46 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  29.26 
 
 		 426 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  31.15 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  28.65 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  32.97 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  32.42 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  32.42 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  29.87 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  30.98 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  29.31 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  30.9 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  29.58 
 
 		 490 aa  87  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  30.37 
 
 		 459 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  29.51 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  29.87 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  30.04 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  30.06 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  27.69 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  29.44 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  31.22 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  28.42 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  30.26 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  29.87 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  29 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  26.78 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  30.74 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  29.87 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  29.69 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  29.87 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  30.43 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  32.43 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  25.79 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  31.19 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  27.92 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  29.13 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  30.94 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  30.39 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  27.59 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  28.57 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  28.57 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  31.28 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  30.05 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  27.42 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  31.89 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  27.57 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  29.67 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  30.77 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>