147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6332 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 380 aa  765    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  54.24 
 
 		 380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  53.81 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  40.65 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  52.22 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  35.78 
 
 		 484 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  38.53 
 
 		 396 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  48.77 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  47.62 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  48.36 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  46.86 
 
 		 450 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  36.36 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  47.22 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  48.57 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  34.34 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  44.19 
 
 		 445 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  45.5 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  45.92 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  45.54 
 
 		 492 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  41.6 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  44.08 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  44.08 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  43.23 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  33.75 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  42.25 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  43.68 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  42.78 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  37.68 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  37.55 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  42.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  36.53 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  40 
 
 		 445 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  33.55 
 
 		 403 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  38.54 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  35.55 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  35.22 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  37.5 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  33.99 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  35.27 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  34.16 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  38.33 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  29.33 
 
 		 444 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  37.78 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  37.23 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  31.39 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  29.69 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  29.63 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  29.63 
 
 		 459 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  33.33 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  30.26 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  29.89 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  31.67 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  30.11 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  32.78 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  25.5 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  30.16 
 
 		 439 aa  96.3  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  32.22 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  30.57 
 
 		 430 aa  95.9  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  34.64 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  29.23 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  29.79 
 
 		 483 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  26.89 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  26.89 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  31.67 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  31.91 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  27.94 
 
 		 433 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  32.28 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  29.69 
 
 		 473 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  29.69 
 
 		 473 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  27.8 
 
 		 437 aa  92.8  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 411 aa  92.8  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  31.38 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  32.4 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  31.58 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  29.02 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  28.65 
 
 		 472 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  30.77 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  31.32 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  31.05 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  29.51 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  29.51 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  32.79 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  27.75 
 
 		 431 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  32.83 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  26.75 
 
 		 426 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  27.24 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  30.54 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  30.88 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  29.89 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  30.05 
 
 		 424 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  29.63 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  30.98 
 
 		 375 aa  86.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  29.95 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  32.22 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  33.52 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  24.44 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  32.07 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>