147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4339 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  100 
 
 		 390 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  69.39 
 
 		 386 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  66.16 
 
 		 391 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  52.08 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  41.87 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  51.23 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  39.39 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  37.27 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  38.36 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  40.77 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  37.64 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  44.03 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  46.86 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  46.6 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  45.67 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  44.44 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  42.58 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  37.58 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  43.11 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  42.86 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  42.86 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  42.03 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  43.33 
 
 		 407 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  43.72 
 
 		 484 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  39.6 
 
 		 492 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  39.68 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  38.95 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  35.88 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  43.09 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  39.06 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  31.68 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  35.91 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  37.5 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  38.46 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  35.19 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  37.5 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  33.33 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  31.81 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  39.67 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  33.16 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  38.27 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  35.2 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  33.81 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  32.37 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  38.25 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  37.44 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  30.92 
 
 		 459 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  31.33 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  30.52 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  35.91 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  36.16 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  33.87 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  35.36 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  35.87 
 
 		 418 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  37.29 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  34.24 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  34.81 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  34.08 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  33.15 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  34.08 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  34.08 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  34.25 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  26.94 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  33.9 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  32.43 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  32.96 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  32.58 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  29.44 
 
 		 439 aa  94  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  31.28 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  33.15 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  31.28 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  33.16 
 
 		 399 aa  93.2  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  29.97 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  33.12 
 
 		 486 aa  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  31.84 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  28.01 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  30.37 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  34.57 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  32.24 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  40.52 
 
 		 446 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  33.99 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  33.15 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  31.46 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  27.67 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  30.1 
 
 		 472 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  30 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  35.33 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  25.71 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  33.86 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  28.42 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  32.24 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  26.14 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  29.3 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  29.53 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  30.56 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  28.4 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  28.8 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  28.8 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  25.48 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>