143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_A0025 on replicon NC_011148
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  100 
 
 		 408 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  39.19 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  34.73 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  42.25 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  43.81 
 
 		 450 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  40.48 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  40.48 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  39.32 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  40 
 
 		 396 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  40.31 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  41.33 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  37.13 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  28.89 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  39.73 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  38.97 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  41.07 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  40.09 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  40.31 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  37.5 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  41.36 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  38.03 
 
 		 410 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  38.73 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  37.91 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  38.43 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  37.44 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  36.73 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  33.84 
 
 		 400 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  41.97 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  35.78 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  36.41 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  39.6 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  34.62 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  34.62 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  34.38 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  35.1 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  33.02 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  34.65 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  29.43 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  32.2 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  31.71 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  36.63 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  37.11 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  30.3 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  26.92 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  27.35 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  26.71 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  28.92 
 
 		 444 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  26.76 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  32.98 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  26.38 
 
 		 363 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  25.64 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  28.11 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  26.39 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  29.68 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  26.15 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  27.62 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  26.6 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  29.14 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  26.32 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  30.16 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  31.45 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  30.05 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  28.18 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  28.65 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  27.87 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  26.49 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  28.18 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  26.67 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  27.89 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  30.6 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  29.35 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  28.16 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  32.58 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  26.83 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  28.18 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  26.88 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  29.19 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  31.03 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  26.72 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  28.04 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  28.42 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  26.4 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  25.39 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  25.33 
 
 		 483 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  25.39 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  29.6 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  25.39 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  24.8 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  27.87 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  25.65 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  28.28 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  25.52 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  27.12 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  29.28 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  27.84 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  27.22 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  27.22 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  27.32 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  27.07 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  28.74 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>