145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2887 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  89.28 
 
 		 401 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 401 aa  782    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  77.48 
 
 		 411 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  75.51 
 
 		 399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  70.9 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  74.35 
 
 		 394 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  74.35 
 
 		 394 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  76.42 
 
 		 399 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  69.44 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  71.68 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  67.17 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  70.29 
 
 		 383 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  69.71 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  67.47 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  67.36 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  66.92 
 
 		 391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  65.12 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  67.1 
 
 		 373 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  63.52 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  59.8 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  57.14 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  58.25 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  57.64 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  58.42 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  58.12 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  55.18 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  60 
 
 		 335 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  54.77 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  52.97 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  50 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  49.74 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  52.55 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  47.34 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  45.32 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  45.94 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  45.57 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  43.6 
 
 		 423 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  45.71 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  43.1 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  44.81 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  45.59 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  43.81 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  42.86 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  45.45 
 
 		 422 aa  282  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  43.94 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  43.14 
 
 		 427 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  42.52 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  44.17 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  43.94 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  43.51 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  38.34 
 
 		 431 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  41.93 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  40.93 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  41.97 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  41.71 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  39.12 
 
 		 418 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  38.53 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  52.6 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  33.98 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  46.31 
 
 		 428 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  40.74 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  41.18 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  38.34 
 
 		 437 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  37.95 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  39.29 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  37.61 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  35.75 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  37.1 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  40.1 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  40.1 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  40.1 
 
 		 472 aa  159  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  36.53 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  37.34 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  37 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  35.07 
 
 		 467 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  33.77 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  41.62 
 
 		 190 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  37.95 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  35.08 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  32.8 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  35.08 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  34.62 
 
 		 483 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  28.5 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  31.11 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  31.11 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  35.56 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  67.09 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  31.13 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  33.51 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  35.91 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  31.12 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32.74 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  32.18 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  35.94 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  32.88 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  34.43 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  32.6 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  34.57 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  34.57 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>