144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0895 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  100 
 
 
467 aa  904    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  63 
 
 
465 aa  535  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  36.15 
 
 
411 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  34.1 
 
 
400 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  35.38 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  35.05 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  39.89 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  33.78 
 
 
402 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  37.13 
 
 
445 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  32.72 
 
 
383 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  35.07 
 
 
401 aa  144  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  30.22 
 
 
394 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  30.22 
 
 
394 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  35.86 
 
 
437 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  30.24 
 
 
399 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  32.29 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  34 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  35.38 
 
 
335 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  30.92 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  27.82 
 
 
388 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  33 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  35.35 
 
 
430 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  33.67 
 
 
472 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  33.8 
 
 
402 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  37.11 
 
 
428 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  34.43 
 
 
392 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  34.72 
 
 
405 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  31.89 
 
 
414 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  33.51 
 
 
473 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  36.68 
 
 
428 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  33.51 
 
 
473 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  35.07 
 
 
386 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  29.53 
 
 
375 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  35.18 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  32.7 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  33.66 
 
 
400 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  30.38 
 
 
373 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  33.69 
 
 
439 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  32.55 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  35.47 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  35.02 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  29.8 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  32.51 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  29.23 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  33.49 
 
 
431 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  30.81 
 
 
418 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 
399 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  33.17 
 
 
393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  33.98 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  31.67 
 
 
415 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  32.09 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  32.35 
 
 
391 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  33.01 
 
 
395 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  31.25 
 
 
384 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  29.55 
 
 
397 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  29.55 
 
 
423 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  30.34 
 
 
388 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  28.51 
 
 
427 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  28.57 
 
 
424 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  34.02 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  32.8 
 
 
398 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  33.15 
 
 
190 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  32.32 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  27.27 
 
 
425 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  32.64 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  25.47 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  28.4 
 
 
420 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  30.73 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  27.35 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  31.22 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  30.73 
 
 
424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  27.27 
 
 
423 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  32.12 
 
 
422 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  31.61 
 
 
426 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  32.12 
 
 
427 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  28.94 
 
 
483 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  31.66 
 
 
423 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  35.48 
 
 
422 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  33.86 
 
 
486 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  31.53 
 
 
403 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  31.53 
 
 
403 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  32.8 
 
 
469 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  35.71 
 
 
379 aa  99  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31.07 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  29.25 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.34 
 
 
410 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  30.57 
 
 
414 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  30.96 
 
 
363 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  30.96 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  25.89 
 
 
450 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  29.44 
 
 
363 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  27.85 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  31.15 
 
 
459 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  28.5 
 
 
457 aa  90.9  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  29.1 
 
 
391 aa  90.1  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  31.18 
 
 
419 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  32.87 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  26.87 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  28.04 
 
 
391 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>