146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2343 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 410 aa  817    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  46.88 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  47.77 
 
 		 428 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  46.08 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  46.43 
 
 		 411 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  44.09 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  35.87 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  34.06 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  44.4 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  34.35 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  44.7 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  34.24 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  46.88 
 
 		 335 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  33.82 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  31.87 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  33.49 
 
 		 427 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  33.41 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  43.32 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  42.86 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  34.74 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  33 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  34.23 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  34.41 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  34.14 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  43.24 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  42.34 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  33.89 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  41.74 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  32.09 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  32.69 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  33.88 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  44.8 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  33.09 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  32.43 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  32.43 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  32.93 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  34.66 
 
 		 400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  33.41 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  31.74 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  33.1 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  32.61 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  31.55 
 
 		 422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  45.92 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  31.46 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  32.69 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  45.92 
 
 		 473 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  45.92 
 
 		 473 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  42.36 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  40.99 
 
 		 431 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  30.17 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  33 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  42.67 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  32.43 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  32.35 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  32.05 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  45.64 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  44.04 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  45.6 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  46.15 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  46.07 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  44.62 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  31.35 
 
 		 439 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  44.81 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  32.45 
 
 		 425 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  41 
 
 		 459 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  43.81 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  37.96 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  32 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  41.15 
 
 		 397 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  46.24 
 
 		 190 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  38.07 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  39.17 
 
 		 490 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  36.71 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  36.71 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  37.67 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  40.64 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  33.98 
 
 		 467 aa  129  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  40.11 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  40.22 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  39.67 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  36.84 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  38.38 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  33.49 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  38.14 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  36.92 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  36.92 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  37.63 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  32.08 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  37 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  35.71 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  30.05 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  31.86 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  33.87 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  35.05 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  30.37 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>