148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1843 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 431 aa  864    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  51.2 
 
 		 399 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  41.47 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  41.9 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  44.29 
 
 		 402 aa  296  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  41.84 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  44.05 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  41.16 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  41.9 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  41.26 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  41 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  40.69 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  40.09 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  41.23 
 
 		 423 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  41.93 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  41.45 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  41.84 
 
 		 427 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  42.99 
 
 		 402 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  40.88 
 
 		 422 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  41.57 
 
 		 424 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  41.12 
 
 		 411 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  40.33 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  41.53 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  39.95 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  40.78 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  40.78 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  41.99 
 
 		 335 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  40.9 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  40.74 
 
 		 425 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  38.95 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  42.08 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  40.98 
 
 		 375 aa  269  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  42.3 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  39.04 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  38.02 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  40.1 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  38.74 
 
 		 396 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  39.44 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  38.52 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  40.05 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  38.63 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  37.65 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  38.35 
 
 		 373 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  39.61 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  39.12 
 
 		 415 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  34.6 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  36.12 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  40.1 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  38.85 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  49.03 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  37.14 
 
 		 428 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  32.87 
 
 		 410 aa  203  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  51.85 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  47.58 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  33.25 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  44.34 
 
 		 397 aa  192  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  44.59 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  46.84 
 
 		 408 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  40 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  35.28 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  39.46 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  39.09 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  39.45 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  35.29 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  37.33 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  41.41 
 
 		 473 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  41.41 
 
 		 473 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  41.41 
 
 		 472 aa  163  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  38.81 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  44.07 
 
 		 190 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  40.7 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  35.35 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  35.02 
 
 		 490 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  33.49 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  36.02 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  31.31 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  31.31 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  34.18 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  34.18 
 
 		 469 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  33.51 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  30.61 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  33.17 
 
 		 422 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  33.82 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  33.82 
 
 		 363 aa  99.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  34.5 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  28.64 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  30.46 
 
 		 450 aa  96.3  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.97 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.05 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  31.63 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  31.12 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  26.92 
 
 		 440 aa  92.8  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  28.23 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  28.44 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  33.82 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  32 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  32.24 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  27.54 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>